水質微型站采用集成式設計原理，包含采配水系統、檢測單元（總磷、總氮、化學需氧量、高錳酸鹽指數、氨氮、常規五參數五個測量模塊）、質量控制單元、輔助單元（廢液收集、防雷、空調等）。